Сотрудничество фонда «Гражданский Союз» с фондом Потанина началось в 2013 году, когда Олег Шарипков прошел обучение в образовательной программе «Целевые капиталы: стратегия роста» и получил 4 млн. рублей на пополнение целевого капитала. В течение нескольких лет фонд Потанина оказывал грантовую поддержку программе Центр знаний по целевым капиталам. В 2020 году «Гражданский Союз» стал одним из получателей средств на помощь пострадавшим в период пандемии коронавируса, распределенных в рамках конкурса «Новое измерение».